会议首先由杨洁勉院长介绍由院党组撰写的分析检查报告的形成过程和主要内容。然后，与会同志在仔细研讨报告的基础上，认真填写了“上海国际问题研究院领导班子分析检查报告群众评议表”。
为进一步贯彻落实深入学习实践科学发展观活动，做好最后整改阶段的各项工作，2009年1月4日上午，我院举行全院学习实践活动整改阶段动员大会，对整改阶段的各项工作进行动员和部署。党组书记、院长杨洁勉出席会议并做了题为“新年开好局，新春起好步”的学习实践活动整改动员讲话，党组成员、副院长陈东晓主持会议。
杨洁勉院长指出，要把学习实践活动整改工作进行常态性落实，以整改计划为中心完成整改阶段的工作，不断加强本院领导班子的思想和能力建设，进一步完善以院中心组和党校为核心的政治学习。整改阶段是学习实践活动的重要环节，下一步要认真完成好整改阶段的各项工作任务，制订切实可行的整改计划，要在院内广泛听取党员和群众的意见，并进行民主测评，还要到院外有关部门进行走访，以开阔视野和思路，使整改更有针对性、更富成效。
2008年12月31日到2009年1月3日，我院赴都江堰地震灾区考察团在党组书记、院长杨洁勉的率领下，走访了都江堰地震灾区居民临时安置点和活动板房学校，访问了上海对口支援都江堰指挥部，听取了都江堰市政府负责同志的介绍，并进行了座谈。
通过实地走访和座谈，考察团对都江堰地震灾区的受灾情况和重建工作有了更直观和深入的了解。虽然都江堰市是受地震损害程度最严重的区域之一，但遇难人数却比较少，这主要得益于当地政府组织高效有力、距离成都交通便捷、附近驻军迅速救援等因素。对于灾后重建工作，上海对都江堰的对口支援不仅体现在工程建设等物质上的帮助，还体现在上海人民真心实意帮助灾区人民重建家园的精神支持。党中央、国务院要求上海对口援建都江堰灾区的工作要为其他灾区的重建工作作出表率。我院考察团一行表示将努力做好本职工作，在力所能及的范围内为灾区的重建尽自己的一份绵薄之力，特别是要在对外交往中多向外宾介绍灾区人民重建家园的巨大成绩和拼搏精神。为表示对灾区人民重建工作的支持，考察团向都江堰外办捐款，以表达上海人民的一份心意。
为了进一步落实学习实践科学发展观活动，深入领会十七大报告中关于生态文明和节能减排的精神，上海国际问题研究院与世界自然基金会（WWF）在2008年12月23日合作举办“气候变化谈判进程和中国低碳发展研讨会”。
本次会议主要采取气候变化重要官员学者主题报告和深度研讨形式，邀请中国气候变化大使于庆泰、上海世博局副局长朱咏雷、清华大学教授何建坤、中国社会科学院城市生态环境中心执行主任潘家华，以及来自环保部、发改委、财政部、中国现代国际关系研究院、北京大学、上海交通大学、世界自然基金会等单位的国内外一流专家和官员与会。院党组书记、院长杨洁勉，党组成员、副院长陈东晓出席了会议，我院部分研究人员参加了研讨会。
与会专家一致认为，无论短期、中期还是长期来看，温室气体减排目标都将制约我国的排放空间，使我国现代化进程面临严峻局面。我国应在国际谈判过程中积极争取战略主动性和发展权益，充分利用此次金融危机带来的历史机遇加大相关领域的投资力度从而为向低碳经济的全面转型做好准备。
杨洁勉院长在会上指出，当前国际体系正在转变，在转变过程中，不仅有机制性转变，价值观念转变，行为主体的转变，也有议题的转变。如果我们能够以气候变化、金融危机为抓手，就能把握国际体系转变的正确方向，做出正确的选择。杨洁勉指出，应对气候变化和建设低碳生活涉及态度、技术、政策等方面，但是最重要的是国家的发展战略目标。气候变化将影响世界几十年甚至上百年，我们需要制定正确的发展方向。